Плохо переваривается еда

Здравствуйте, мой сынуля, которому ровно 2 годика, плохо переваривает еду. Независимо от того, что мы ему готовим на ужин, будь то каша, борщ и т.д., в его стуле можно увидеть кусочки непереваренной пищи. Кроме того, заметили, что он стал часто ходить в туалет (хотя это не диарея), иногда до 4 раз за день. Мы не знаем, стоит ли лечить такое состояние или это пройдет само собой? К тому же, у нас скоро назначена прививка. Можно ли ее делать в таком состоянии малыша? И у нашего ребенка с 2 месяцев был диагностирован Атопический дерматит, который проявляется в основном на ногах. Может ли это быть связано с проблемой переваривания или это две отдельные проблемы? Спасибо заранее за ответы.